Rok 2025 přinesl do oblasti DPH mimořádně rozsáhlé změny. Nebyly provedeny jen „kosmetické“ úpravy zákona, ale zásahy, které se promítly do každodenní agendy plátců – od registrace a sledování obratu pro plátcovství DPH, přes uplatňování a korekce odpočtu, až po úpravy v oblasti zdaňování nájmu a převodu nemovitých věcí. Rok 2026 nebude z hlediska počtu novinek v oblasti DPH tak dynamický, promítnou se v něm ale změny zákona z předchozích období.

V tomto článku pro Vás shrnujeme nejdůležitější novinky v DPH v roce 2026 a upozorňujeme na nedávné i chystané informace GFŘ vydané v souvislosti se zásadními změnami v oblasti DPH.

1) Klíčové změny od 1. 1. 2026

Novela zákona o DPH přinášející významné změny pro rok 2025 zúžila rozsah finančních činností dle § 54 zákona o DPH, které jsou osvobozeny od DPH bez nároku na odpočet. Tato změna měla z důvodu nutnosti delší přípravy finančních institucí odloženou účinnost, a to až od 1.1.2026. Od tohoto data již nejsou od DPH bez nároku na odpočet osvobozeny služby obstarávání inkasa, vedení evidence investičních nástrojů, služba vybírání rozhlasových nebo televizních poplatků a také výplata dávek důchodového pojištění nebo vybírání opakujících se plateb obyvatelstva.

Od roku 2026 dojde k úpravě podmínek osvobození vývozu zboží v osobních zavazadlech cestujících ze třetích zemí, kteří zboží nakoupili pro jiné než obchodní účely. Podmínky osvobození upravují nově v § 66 zákona o DPH odstavce 3 až 6.

Výraznými změnami prochází od roku 2026 systém vrácení DPH dle ustanovení § 80 zákona o DPH a paragrafů následujících. Dochází k úpravám pravidel pro vrácení DPH osobám požívajícím výsad a imunit a zpřesňují se pravidla pro vracení DPH mezinárodním organizacím se sídlem mimo ČR.

Zásadní změnou je zavedení nového institutu vrácení bezdůvodně zaplacené DPH. Hlavním cílem navržené úpravy je umožnit kupujícímu, aby požádal správce daně o vrácení bezdůvodně zaplacené daně. Vrácení bezdůvodně zaplacené daně lze požadovat přímo po správci daně pouze ve výjimečných případech, kdy je nemožné či nadměrně obtížné, aby poskytovatel plnění vrátil daň zákazníkovi, a při splnění stanovených podmínek (definovaných v novém § 81 zákona o DPH).

V neposlední řadě by od počátku roku 2026 měli zpozornět ti, co dodávají zboží zákazníkům, kteří jej hodlají vyvézt do třetí země, a kde je možno požádat o vrácení DPH dle ustanovení § 84 zákona o DPH. Novelizovaná zákonná úprava nejen přidává povinnosti při vystavování listinných dokladů o prodeji ze strany prodejce, obsahuje také významnou změnu v oznamování těchto obchodů. Nově musí prodejce zaslat bezprostředně po prodeji zboží data uvedená na vystaveném dokladu o prodeji Celní správě ČR. Tato data bude mít cestující na letišti k dispozici prostřednictvím tzv. kiosku Celní správy, jehož prostřednictvím dojde k potvrzení výstupu zboží mimo EU. Pokud prodávající nedostane ze systému Celní správy zpětné potvrzení odeslání dat, musí data do systému nahlásit znovu, a to nejpozději následující den. O vrácení DPH pak cestující může požádat prodávajícího do 6 měsíců od uskutečnění prodeje. Prodávající pak o tuto DPH požádá stát v rámci svého řádného DPH přiznání. Aby tak mohl učinit, musí mít potvrzený výstup zboží z EU a zároveň musí cestujícímu příslušnou DPH vyplatit.

2) Nová formulářová podání

Od 1. 1. 2026 nabývá účinnosti vyhláška č. 387/2025 Sb. o formulářových podáních pro DPH, která stanoví obsahovou strukturu a formát elektronických formulářů pro DPH (DPH přiznání, souhrnné hlášení, kontrolní hlášení a další podání). Nezapomeňte proto ověřit, zda v roce 2026 podáváte DPH reporty na správných formulářích a aktualizujte Vámi používané softwarové systémy.

3) Rok 2026 jako „první ostrý dopad“ registračních pravidel zavedených od 1. 1. 2025

Ačkoli nabyla nová pravidla registrace a sledování obratu účinnosti už od 1. 1. 2025, rok 2026 je pro mnohé podnikatele první rok, kdy se změna skutečně projeví. Novela stanovila, že při překročení obratu 2 000 000 Kč za období kalendářního roku se osoba povinná k dani stává plátcem až od 1. 1. následujícího kalendářního roku, pokud neoznámí dřívější dobrovolný vstup do plátcovství. Dané platí pouze v případě, kdy v kalendářním roce nepřesáhl podnikatel druhý obrat ve výši 2 536 500 Kč. Pokud se tak stalo, stal se podnikatel plátcem ode dne následujícího po překročení „druhého“ obratu.

Pokud nejste dosud plátcem DPH, doporučujeme si hned na začátku roku zkontrolovat tržby realizované v roce 2025 a spočítat si obrat pro vznik plátcovství DPH. Obecně je doporučováno obrat sledovat na pravidelné bázi, mnoho drobných podnikatelů nebo nově založených firem na to však zapomíná.

4) Nové informace GFŘ

Těsně před koncem roku vydalo Generální finanční ředitelství Informaci ke změnám v uplatňování nároku na odpočet DPH. Informace se věnuje zákonné úpravě účinné již od roku 2025 a vztahuje se tedy i na skutečnosti nastalé před jejím vydáním.

Informace GFŘ poskytuje komentář k (ne)uplatnění nároku na odpočet DPH u přeshraničního režimu pro malé podniky, k uplatnění nároku při registraci plátce, vysvětluje uplatnění DPH u osobních automobilů a obecně při pořizování dlouhodobého majetku a shrnuje i jednotlivé lhůty, které je při uplatnění nároku potřeba dodržet.  Poměrně rozsáhle se informace věnuje i uplatnění krácených nároků na odpočet, ať už dle ustanovení § 75 nebo § 76 zákona o DPH. Jelikož se tyto úpravy týkají především posledního zdaňovacího období roku 2025, doporučujeme tomuto tématu věnovat dostatečnou pozornost.

Dlouho očekávaná informace o uplatnění DPH u nemovitých věcí po 1.7.2025 zatím vydána nebyla.

✉ Sledujte naše Tax News pro další aktuality z oblasti účetnictví, daňového práva a judikatury Nejvyššího správního soudu.