Od ledna 2026 dochází k důležité změně týkající se způsobu podávání hlášení Intrastat, na kterou by se měly připravit podniky, kterých se tato povinnost týká.

Ukončení aplikace InstatDesk

Dosavadní desktopová aplikace InstatDesk bude naposledy použitelná pro podání výkazu za prosinec 2025. Od referenčního období leden 2026 už nebude možné hlášení přes InstatDesk podávat.

Důvodem je ukončení podpory technologických komponent, na kterých je systém postaven. Opravy v hlášení Intrastat, která byla odeslaná aplikací InstatDesk, bude možné opravit pouze v původní aplikaci. Pro potřeby oprav hlášení za rok 2025 je proto doporučeno ponechat si InstatDesk nainstalovaný až do 16. července 2026 (včetně), kdy je naposledy možné opravovat výkazy Intrastatu podané za měsíce roku 2025. Poté lze aplikaci bezpečně odinstalovat.

Nová aplikace InstatEvo

Nástupcem InstatDesku i dosavadní online verze InstatOnline je nová aplikace InstatEvo, která je zpřístupněná již od 1. července 2025 a zpravodajské jednotky na ní mohou najet již nyní. InstatEvo je​ webová aplikace běžící v prohlížeči, dostupná odkudkoli a bez nutnosti instalace. Od ledna 2026 bude jediným prostředkem pro podávání hlášení. Uživatelská příručka pro InstatEvo je dostupná na stránkách celní správy.

Hlavními výhodami aplikace InstatEvo je:

• možnost importu neomezeného počtu vět z CSV souborů,
• kontrola správnosti dat při jejich zadávání,
• ověření odeslaných údajů přímo na serveru,
• použití na počítači i mobilu bez instalace dalších programů, nezávisle na operačním systému,
• přihlášení stejnými údaji jako v InstatDesku – bez nutnosti nové registrace.

Je nutné počítat s tím, že InstatEvo neobsahuje historická data odeslaná v InstatDesku – začíná se tedy zcela od začátku. Doporučujeme seznámit se s novou aplikací InstatEvo raději v předstihu, tedy ještě před koncem roku 2025.

Reorganizace celní správy

Novinkou od 1. července 2025 jsou také změny související s reorganizací Celní správy, na základě které došlo ke změně struktury celních úřadů. Reforma celní správy snižuje počet úřadů z 15 na 6, což může mít praktické dopady na komunikaci s podnikateli. Přehled nových celních úřadů a jejich územní působnosti naleznete na webových stránkách Celní správy ČR.

Z některých krajských úřadů se stávají pracoviště  (např. CÚ pro Kraj Vysočina zrušen  –  nově Celní úřad v Brně, pracoviště Střítež), část původních pracovišť (poboček) byla zrušena (např. Žďár nad Sázavou). Osoby registrované k DPH, které nemají v ČR sídlo, provozovnu ani místo podnikání, spadají nově pod Celní úřad v Plzni (dosud Praha).

✉ Sledujte naše Tax News pro další aktuality z oblasti účetnictví, daňového práva a judikatury Nejvyššího správního soudu.